COVID-19 Korona Virüsün Kökeni Evrimi

  • 16-04-2020 04:06
  • 189

Korona Virüste Komplo Teorileri 

2019 yılı sonlarında Çin'in Wuhan şehrinde ortaya çıkıp bugüne kadar milyonlarca insanı etkileyen COVID-19 salgını ve bu salgına neden olan SARS-CoV-2 Korona virüsü ile ilgili pek çok komplo teorisi mevcut.

Bu komplo teorilerinin bir çoğu korona virusun kasıtlı olarak labaratuvarlarda yaratılmış olduğu fikrine dayanıyor. Fakat muhtemelen bu ve buna benzer iddialar tıpkı daha önce SARS ve MERS te olduğu gibi manipülasyon olarak kalmaya devam edecek. Bugüne kadar yapılan SARS-CoV-2 korona virüsü ve diğer korona virüslerin genom dizisi verilerinin analizlerinde, bu virüslerin bir laboratuvarda üretildiğine veya başka bir şekilde tasarlandığına ilişkin hiçbir kanıt bulunamadı dahası yapılan tüm araştırmalar bu viruslerin doğal evrimin bir ürünü olduğuna işaret eden bulgularla dolu. 

Scripps Research'te immünoloji ve mikrobiyoloji doçenti olan Kristian Andersen "Bilinen koronavirüs suşuları için mevcut genom dizisi verilerini karşılaştırarak, SARS-CoV-2'nin doğal süreçlerden kaynaklandığını kesin olarak belirleyebiliriz" diyor. Andersen ve Tulane Üniversitesi'nden Robert F. Garry; Sydney Üniversitesi'nden Edward Holmes; Edinburgh Üniversitesi'nden Andrew Rambaut; ve Columbia Üniversitesi'nden W. Ian Lipkin'nin birlikte hazırladıkları makalelede (The proximal origin of SARS-CoV-2) de bu doğal süreci kanıtlayan görüşler paylaşılmakta.

SARS-CoV-2 COVID-19 Pandemi Süreci 

Koronavirüsler, ciddi salgın hastalıklara neden olabilecek geniş bir virüs ailesidir. Koronavirüsün neden olduğu bilinen ilk ciddi hastalık, Çin'de 2003 yılında Şiddetli Akut Solunum Sendromu (SARS) salgını olarak başladı, daha sonra ise 2012 yılında Suudi Arabistan'da Orta Doğu Solunum Sendromu (MERS) olarak bilinen salgın hastalık ortaya çıktı. Ancak bu salgınlar ciddi sorunlara neden olsada SARS-CoV-2 nin yarattığı ölçüde bir pandemiye neden olmadı. 

Tarihler 31 Aralık 2019 u gösterdiğinde Çinli yetkililer, Dünya Sağlık Örgütü'nü, daha sonra SARS-CoV-2 olarak adlandırılacak ciddi bir hastalığa neden olan yeni bir koronavirüs suşusunun patlak vermesi konusunda uyardı. Bu başlamış olan salgının ilk duyurusu ve aynı zamanda verilen ilk tehlike sinyaliydi. (Sonrasında binlerce insan hastalandı ve öldü.)

Salgın başladıktan kısa bir süre sonra Çinli bilim adamları SARS-CoV-2 genomunu sıraladılar ve verileri dünya çapındaki araştırmacılar için kullanılabilir hale getirdiler. Ortaya çıkan genomik dizi verileri, Çinli yetkililerin salgını hızla tespit ettiğini ve COVID-19 vakalarının sayısının, insan popülasyonuna tek bir girişten sonra insandan insana bulaşmasından dolayı artmakta olduğunu göstermiştir. Andersen ve diğer birçok araştırma kurumundaki ortak çalışanlar, bu sıralama verilerini virüsün çeşitli anlatım özelliklerine odaklanarak SARS-CoV-2'nin kökenlerini ve evrimini keşfetmek için kullandılar.

Bilim adamları, insan ve hayvan hücrelerinin dış duvarlarına yapışmak ve nüfuz etmek için kullandığı virüsün dış tarafındaki armatürler için genetik proteinleri, genetik şablonu analiz ettiler. Daha spesifik olarak, spike proteininin iki önemli özelliğine odaklandılar: reseptör bağlanma alanı (RBD), konakçı hücreleri kavrayan bir tür çengelli kanca ve virüsün açılmasını ve konakçı hücrelere girmesini sağlayan bir moleküler kutu açıcı olan yarılma bölgesi.

 

Korona Virüste Doğal Evrimin Kanıtları

Bilim adamları, SARS-CoV-2 spike proteinlerinin RBD bölümünün, kan basıncını düzenlemede yer alan bir reseptör olan ACE2 adı verilen insan hücrelerinin dışındaki moleküler bir özelliği etkili bir şekilde hedeflemek için evrimleştiğini buldular. SARS-CoV-2 spike proteini, insan hücrelerine bağlamakta o kadar etkili oldu ki, bilim adamları bunun genetik mühendisliğinin ürünü değil, doğal seleksiyonun ürünü olduğu sonucuna vardı.

Doğal evrim için bu kanıt, SARS-CoV-2'nin omurgası - genel moleküler yapısı hakkındaki verilerle desteklenmiştir. Birisi patojen olarak yeni bir koronavirüs üretmeye çalışsaydı, hastalığa neden olduğu bilinen bir virüsün omurgasından inşa ederdi. Ancak bilim adamları, SARS-CoV-2 omurgasının zaten bilinen koronavirüslerden önemli ölçüde farklı olduğunu ve çoğunlukla yarasalarda ve pangolinlerde bulunan ilgili virüslere benzediğini buldular.

Andersen, "Virüsün bu iki özelliği, spike proteininin RBD kısmındaki mutasyonlar ve farklı omurgası nedeniyle, laboratuvar manipülasyonunu SARS-CoV-2 için potansiyel bir kaynak olarak dışlıyor" dedi.

İngiltere merkezli Wellcome Trust'taki salgın doktoru Phie Josie Golding, Andersen ve meslektaşlarının bulgularının "virüsün kökenleri hakkında dolaşan söylentilere kanıta dayalı bir görüş getirmek için çok önemli olduğunu söylüyor ve Virüsün doğal evrimin bir ürünü olduğu sonucuna varıyorlar," diye ekliyor, "bu kasıtlı genetik mühendisliği hakkındaki spekülasyonları sonlandırıyor."

 

Korona Virüsünün Olası Kökenleri

Genomik sekanslama analizlerine dayanarak, Andersen ve çalışma arkadaşları SARS-CoV-2'nin en olası kökenlerinin iki muhtemel senaryodan birini izlediği sonucuna vardı.

Bir senaryoda virüs, insan olmayan bir konakta doğal seleksiyon yoluyla mevcut patojenik durumuna evrildi ve daha sonra insanlara atladı. Önceki koronavirüs salgınları insanların misk kedilerine (SARS) ve develere (MERS) doğrudan maruz kalıp virüse yakalanmalarıyla birlikte ortaya çıktı. Araştırmacılar, yarasa koronavirüsüne çok benzediği için yarasaları SARS-CoV-2 için en olası rezervuar olarak önerdiler. Bununla birlikte, yarasalar ve insanlar arasında bir ara konağın muhtemelen var olduğunu gösteren, belgelenmiş doğrudan yarasa-insan iletimi vakası yoktur.

Bu senaryoda, SARS-CoV-2'nin spike proteininin ayırt edici özelliklerinin her ikisi de - hücrelere bağlanan RBD kısmı ve virüsü açan bölünme bölgesi - insanlara girmeden önce mevcut durumlarına dönüşecekti. Bu durumda, salgın muhtemelen insanlar enfekte olur olmaz hızlı bir şekilde ortaya çıkacaktı, çünkü virüs onu patojenik hale getiren ve insanlar arasında yayılabilen özellikleri geliştirmiş olacaktı.

Önerilen diğer senaryoda, virüsün patojenik olmayan bir versiyonu bir hayvan konakçısından insanlara sıçradı ve daha sonra insan popülasyonundaki mevcut patojenik durumuna evrildi. Örneğin, Asya ve Afrika'da bulunan armadillo benzeri memeliler olan pangolinlerden elde edilen bazı koronavirüsler, SARS-CoV-2'ye çok benzer bir RBD yapısına sahiptir. Bir pangolin'den gelen bir koronavirüs, doğrudan veya misk kedileri veya yaban gelinciği gibi bir aracı konak yoluyla bir insana bulaşmış olabilir.

Daha sonra, bölünme bölgesi olan SARS-CoV-2'nin diğer belirgin spike proteini, muhtemelen salgının başlamasından önce insan popülasyonunda sınırlı saptanmamış dolaşım yoluyla bir insan konakçı içinde evrimleşmiş olabilir. Araştırmacılar, SARS-CoV-2 bölünme bölgesinin, insanlar arasında kolayca bulaştığı gösterilen kuş gribi suşlarının bölünme bölgelerine benzediğini buldular. SARS-CoV-2, insan hücrelerinde böyle virülan bir bölünme bölgesini geliştirebilir ve kısa bir süre sonra koronavirüs insanlar arasında yayılma yeteneğine sahip olabileceğinden mevcut salgını başlatabilirdi.

Edinburgh Üniversitesi'nden ve bu çalışma ortak yazarı Andrew Rambaut, bu noktada hangi senaryoların büyük olasılıkla olduğunu bilmenin imkansız olmadığı konusunda uyardı. SARS-CoV-2, insanlara mevcut patojenik formunda bir hayvan kaynağından girdiyse, virüsün hastalığa neden olan türü hala hayvan popülasyonunda dolaşabileceği ve bir kez daha atlayabileceği için gelecekteki salgınların olasılığını artırır. insanlar. İnsan popülasyonuna giren ve daha sonra SARS-CoV-2'ye benzer gelişen özelliklerin patojenik olmayan bir koronavirüs olasılığı daha düşüktür.

 

Referanslar

Nature Medicine,

The proximal origin of SARS-CoV-2.

Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes, Robert F. Garry.